由于党政机构个数限制，县区一级的畜牧兽医局，一般设置为事业单位。在新一轮党政机构改革中，以及事业单位分类改革中的“承担行政职能的事业单位改革方案”中，明确规定撤销原畜牧兽医局，将其承担的动物诊疗机构许可、职业兽医注册备案、兽药经营许可等行政职能划入新组建的农业农村局。也有为了工作考虑，保留畜牧兽医局牌子，和新组建成立的农业农村局合署办公。
因为挂牌机构不能实体化，因此即使是挂牌或者合署办公，县区一级的畜牧兽医局机构，都算是撤销了。同时，按照“行政执法机构改革方案”规定，隶属于县区畜牧兽医局管理的动物卫生监督管理所，也就是动物卫生方面的检疫执法机构，也随同改革，职能和人员、编制整体归并到新成立的农业农村执法大队，统一执行农业农村领域内的行政执法职能，为参公管理的事业单位。
县区执法农业农村执法大队实行“局队合一”的模式设置，大队长由农业农村局局长兼任，设置一至两名专职副队长，为副科级级别。原动物卫生执法人员中，具备执法资质的参公人员可整合到农业农村执法大队工作，工人和其他人员分流到事业单位。畜牧兽医局撤销后，其承担的公益服务职能保留，成立畜牧服务中心，依然为正科级事业单位，隶属农业农村局管理，继续承担畜牧兽医技术推广服务等公益服务职能。
原参公人员部分可按照“编随事走、人随编走”的原则，整合到农业农村局机关任职，过渡为公务员，置换为行政编制。由于县区行政编制太少，各党政机关都有着严重的超编问题，因此转到机关的人员非常少，基本上都是领导干部。大部分参公人员和未登记参公的干部，以及工勤人员，都将保留在畜牧服务中心，随同事业单位分类改革政策，统一安置。
乡镇综合行政执法队和畜牧局机关哪个好？
我觉得这个不好说，我们要具体情况具体分析，更重要的是还要看自己的情况，在很多信息不清楚的情况下，我们可以从几个方面来考虑：1.从单位的性质来考虑。我们首先要确认乡镇综合执法队和畜牧局这两个单位的性质，一般情况来说应该都是事业单位，但不同的地方单位的属性也不尽相同。如果其中有一个是行政单位，我们进去以后能够获得公务员身份的话，那肯定不用犹豫去这个行政单位，毕竟公务员各方面的待遇都比事业人员的待遇要好很多。
如果两个单位都是事业单位，或者两个单位都是行政单位，我们去两个单位都能够获得同样的身份，那就要从工作环境和个人的有关情况来考虑了。2.从工作的环境来考虑一般来说，乡镇综合执法队是在乡镇上班，而畜牧局一般是在县城上班。普遍来说，乡镇的工作压力和任务会比县直单位的压力和任务重很多，而且乡镇工作除了县城城区的乡镇外基本上都离家里更远一些，这是基于两个单位在同一个地方来说的。
如果两个单位不在同一个地方，那我们要考虑的除了待遇的差异外，工作环境还要根据两地的实际情况来深入分析。3.从个人的情况来考虑一般来说，选择乡镇会更辛苦，但更锻炼人。选择畜牧局工作更单纯，但离家近，比较安逸。具体选择哪个职业，关键还要看自己更喜欢哪个。别人说的再多都只是建议，要知道具体要工作的是我们自己。
乡镇畜牧兽医站该怎么改革？会整合到乡镇府吗？
乡镇畜牧兽医站一直承担着基层畜牧业的防疫，诊疗，以及重大动物疫病的管控的重任 。特别是最近几年的环保，安全也压在基层上，基层存在严重缺编。为了从根本上解决，在撤乡并镇之后，应该设立村级动物防防疫站。通过专业培训，掌握基本技能，国家给予一定的补偿，如购买养老保险等，既保证了村上的防疫免疫，普通疾病诊疗。
县畜牧兽医局如何改革？乡镇畜牧服务中心如何改革？
我是一名基层的畜牧兽医体制内工作人员，在畜牧兽医这个行业工作了近三十年，作为一名老人，对畜牧兽医体制改革有着切身的体会。在上世纪八九十年代，那时候我们的农村存栏着大量的牲畜，几乎家家户户都有大家畜，至于猪鸡更是常见的，那时候县级叫畜牧兽医站，后来叫畜牧兽医中心（也有叫畜牧中心的），主要的工作就是动物防疫、市场上的动物检疫、还有就是畜牧技术推广和饲草料建设，基本工作和现在差不多。
