南京大学和南京理工大学是全国排名前两位的大学。2019年最新一轮全国大学排名中，南京大学排名第8，南京理工大学排名第50。上世纪末，中国出现了大学合并潮。南京大学是上世纪末大学合并潮中没有合并的大学之一。虽然南京大学没有合并其他大学，但是南京大学还是很强的！南京大学这么厉害，但能在全国高校中排第三吗？这个问题真的不好回答！其实中国的常春藤大学C9联盟都是顶尖大学，实力相当。如果非要排名的话，我觉得第三名应该在浙大和复旦之间。无论是双一流还是第四轮学科评估，浙江大学都排在全国第三，仅次于清华北大。
南京大学与南京理工大学都是国内顶尖的两所大学，在2019年最新一轮的全国高校排名中，南京大学排第8名，南京理工大学排第50名。总的来说，两校有以下区别1.学校类型不同南京大学属于综合类，南京理工大学属于理工类。南京大学的院系设置更为全面包含33个院系南京理工大学更偏向于理工类专业，共有20个院系。
南京大学设有86个本科专业，南京理工大学设有38个本科专业。2.主管部门不同南京大学主管部门为中华人民共和国教育部，是中央直管副部级建制南京理工大学主管部门为中华人民共和国工业和信息化部。3.学校属性不同南京大学是全国重点大学985工程211工程双一流世界一流大学A类建设高校院校南京理工大学是全国重点大学211工程985平台世界一流学科建设高校。
相比之下南京大学更为拔尖。4.办学层次不同南京大学的办学层次为世界知名高水平大学前列南京理工大学办学层次为中国一流大学特色。5.重点学科不同南京大学有世界一流学科建设学科15个，国家重点学科一级学科8个，二级学科13个南京理工大学有世界一流学科建设学科1个，国家重点学科一级学科2个，二级学科7个。
6.建校历史不同南京大学可追溯自孙吴永安元年258年的南京太学，近代校史肇始于1902年创建的三江师范学堂，1949年由民国时期中国最高学府国立中央大学易名国立南京大学，1950年径称南京大学并沿用至今。南京理工大学创建于1953年，前身是中国人民解放军军事工程学院哈军工炮兵工程系。
7.学校简称学校代码地理位置不同南京大学简称南大，学校代码为10284，校址位于南京市鼓楼区汉口路22号南京理工大学简称南理工，学校代码为10288，校址位于南京市玄武区孝陵卫街道孝陵卫街200号。无论如何，小编认为这两所学校都是国内很好的大学，虽然南京大学比南京理工大学各方面都强不少，但南京理工大学同样培养出了不少类似于任新民李鸿志崔向群张国清等国家两院和科技人才。
感谢邀请!我是百Win中学教师，很高兴能回答这个问题啊！南京是六朝古都
